Doutorado em Química
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Navegando Doutorado em Química por Orientador(a) "Paula, Daniela Aparecida Chagas De"
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Item Acesso aberto (Open Access) Integrating Metabolomics and Computational Tools to Discover Anti-Inflammatory Agents in Ocotea Species(Universidade Federal de Alfenas, 2024-10-04) Katchborian Neto, Albert; Paula, Daniela Aparecida Chagas De; Pilon, Alan César; Silva, Denise Brentan Da; Costa, Fernando Batista Da; Koolen, Hector FerreiraA busca por agentes anti-inflamatórios inovadores com menos efeitos colaterais é uma área de grande interesse na pesquisa farmacêutica. A inibição da liberação de prostaglandina E2 (PGE2) e leucotrieno B4 (LTB4) é relevante pois estes são mediadores chave em diversas doenças inflamatórias. Produtos Naturais (PN) oferecem uma rica fonte de metabólitos especializados, estruturalmente diversos e funcionalmente distintos, que podem auxiliar na descoberta de novos agentes terapêuticos. Neste contexto, nossa pesquisa explorou o potencial anti-inflamatório ex vivo de 60 extratos de plantas do gênero Ocotea, muitas estudados pela primeira vez. O objetivo deste projeto consiste em aplicar ferramentas computacionais de metabolômica para anotar biomarcadores associados à atividade anti-inflamatória e modelos de aprendizado de máquina para prever novos extratos de Ocotea ativos. A composição química de várias espécies endêmicas e ameaçadas de Ocotea de diferentes biomas no Brasil foram analisadas, levando à anotação de múltiplas classes de metabólitos especializados. O Capítulo I apresenta uma revisão clássica de todos os metabólitos identificados dentro do gênero Ocotea, culminando na criação de um banco de dados abrangente chamado OcoteaDB. Esta revisão da literatura também explora as vias biossintéticas relevantes dos esqueletos químicos bioativos no gênero. O Capítulo II é um artigo de pesquisa de um estudo metabolômico que revelou que a inibição da liberação de PGE2 em espécies de Ocotea pode ser atribuída majoritariamente a alcaloides do tipo aporfina. Ao empregar cromatografia líquida de ultra performance acoplada à espectrometria de massas de alta resolução (CLAE-EM) combinada com o OcoteaDB, alcançamos um processo de anotação rápido e confiável. O Capítulo III é um artigo de pesquisa sobre biomarcadores inibidores duais das vias COX/LOX em espécies promissoras de Ocotea, utilizando uma abordagem metabolômica concatenada CLAE-EM - Ressonância Magnética Nuclear (RMN) e modelos de predição por aprendizado de máquina. Desta vez, os alcaloides, seguidos por um flavonoide glicosilado e um sesquiterpenoide foram correlacionados com a atividade anti-inflamatória dual. O Capítulo IV solidifica a importância do gênero Ocotea como um produtor de diferentes classes de alcaloides, lignoides e flavonoides glicosilados, utilizando reações de fragmentação em fase gasosa e redes moleculares no processo de anotação. Foi criado um pipeline aberto CLAE-EM-DIA (aquisição de dados independente) pela integração da conversão de dados, processamento e análise usando ferramentas metabolômicas. Esta tese gerou conhecimento sobre o metaboloma e o perfil anti-inflamatório de várias espécies de Ocotea ainda não estudadas, e um fluxo de trabalho para futuras análises computacionais de PN. O conhecimento científico gerado pode ser aplicado na busca de novas substâncias ativas na inflamação e também contribuir para destacar a relevância da conservação de plantas do gênero Ocotea no Brasil, estimulando a preservação de suas espécies para futuras pesquisasItem Acesso aberto (Open Access) Isolamento bioguiado de substâncias antiurolíticas e anti-inflamatórias de Cissus gongylodes (vitaceae)(Universidade Federal de Alfenas, 2024-12-17) Salem, Paula Pio De Oliveira; Paula, Daniela Aparecida Chagas De; Dias, Danielle Ferreira; Silva, Eliane De Oliveira; Vidal, Diogo Montes; Pimenta, Lúcia Pinheiro SantosA Cissus gongylodes tem sido tradicionalmente utilizada na dieta de povos indígenas no Brasil e na medicina tradicional para a remoção de cálculos renais e doenças inflamatórias. Este estudo teve como objetivo isolar, pela primeira vez, substâncias presentes na decocção das folhas de C. gongylodes responsáveis por suas propriedades etnofarmacológicas anti-inflamatórias e antiurolíticas. As frações mais ativas da decocção foram fracionadas utilizando C18 em sistema SPE, e as substâncias foram purificadas por HPLC-UV-DAD. A atividade anti-inflamatória foi avaliada utilizando um ensaio ex vivo em sangue humano induzido por LPS e ionóforo de cálcio, medindo mediadores inflamatórios, PGE2 e LTB4. A atividade antiurolítica foi avaliada utilizando um modelo experimental in vitro com urina humana para determinar a dissolução dos cristais de oxalato de cálcio. Além disso, a decocção foi caracterizada quimicamente pela análise metabolômica utilizando UHPLC-ESI-HRMS. As substâncias isoladas, incluindo rutina, eriodictyol 3′-Oglicosídeo e isoquercetina, demonstraram ações multi-alvo significativas. Esses componentes atuam como agentes anti-inflamatórios, inibindo a síntese dos principais mediadores inflamatórios, PGE2 e LTB4. Além disso, exibem propriedades antiurolíticas, promovendo a dissolução de cristais de oxalato de cálcio. A caracterização da decocção por UHPL-HRMS revelou um alto teor de flavonoides, principalmente flavonoides glicosilados. Os resultados sustentam o uso tradicional da decocção de C. gongylodes, identificando as substâncias responsáveis por seus efeitos anti-inflamatórios e antiurolíticos. A ação multi-alvo exibida por C. gongylodes é particularmente desejável no tratamento da urolitíase, uma vez que a inflamação e a produção de PGE2 precedem e contribuem para a formação de cristais de CaOx nos rins. Com base nessas ações, C. gongylodes se destaca como uma fonte potente de compostos ativos para o desenvolvimento de novos tratamentos para a urolitíase.Item Acesso aberto (Open Access) Metabolômica, Fitoquímica e Avaliação do Potencial An--inflamatório de Espécies de Lauraceae(Universidade Federal de Alfenas, 2023-11-01) Alcântara, Bianca Gonçalves Vasconcelos De; Paula, Daniela Aparecida Chagas De; Silva, Marcelo Aparecido Da; Ambrozin, Alessandra Regina Pepe; Sartorelli, Patrícia; Nicácio, Karen De JesusA família Lauraceae possui uma grande diversidade de gêneros e espécies, das quais várias espécies são endêmicas do Brasil. Algumas espécies dessa família demonstraram propriedade anti-inflamatória para seus extratos ou substâncias isoladas. A inflamação é um distúrbio presente em uma ampla gama de patologias, que representa um alvo relevante de estudos para descoberta de novos tratamentos. Nesse contexto, este trabalho teve como objetivo avaliar a atividade anti-inflamatória de espécies pertencentes à família Lauraceae. Além disso, fazer um estudo metabolômico destas espécies, obter um modelo de predição in silico de atividade antiinflamatória e selecionar uma espécie para realizar o estudo fitoquímico. Foi utilizada UPLCHRMS para o estudo metabolômico. Utilizou-se modelo ex vivo para a avaliação antiinflamatória, além de ferramentas estatísticas para obtenção do modelo de predição da atividade anti-inflamatória de extratos vegetais da família Lauraceae. A partir das estratégias metabolômicas foi possível direcionar o isolamento e purificação de um biomarcador de atividade anti-inflamatória. Os resultados ex vivo demonstraram que a maioria das espécies apresentou atividade anti-inflamatória superior a 50% de inibição,sendo que as espécies Ocotea diospirifolia, Cinnamomum glaziovii, Nectandra membranacea, Ocotea odorifera e Persea major apresentaram os maiores valores de porcentagem de inibição de PGE2, estando acima de 77% de inibição. Diversos extratos demonstraram atividade anti-inflamatória pela primeira vez. Ainda, o estudo metabolômico permitiu caracterizar quimicamente as amostras e construir um modelo de predição PLS robusto, com valores de R 2 = 0,99 e Q 2 = 0,92 e valores preditos na validação externa muito próximos dos valores reais. Além disso, modelos adicionais de aprendizado de máquina ANN e SGD demonstraram ser robustos e corroboraram os resultados do modelo PLS. Entre os biomarcadores positivamente correlacionados com a atividade antiinflamatória, os alcaloides do tipo aporfínicos e benzilisoquinolínicos foram anotados com nível 2 de confiança, conforme diretrizes metabolômicas. Além disso, foi possível isolar um dos biomarcadores da atividade anti-inflamatória, o novo alcaloide 2,10-dimetoxiaporfina, da espécie O. odorifera. Desta forma, este trabalho de uma maneira geral, produziu conhecimento novo sobre 18 espécies da família Lauraceae, que poderá servir de subsídio para futuros estudos de espécies da família Lauraceae; além de evidenciar o potencial para descoberta de novos compostos químicos.