Mestrado em Biotecnologia

URI Permanente para esta coleçãohttps://repositorio.unifal-mg.edu.br/handle/123456789/2644

Navegar

Navegando Mestrado em Biotecnologia por Orientador(a) "Silveira, Nelson José Freitas Da"

Filtrar resultados informando as primeiras letras
Agora exibindo 1 - 3 de 3
  • Imagem de Miniatura
    ItemAcesso aberto (Open Access)
    Abordagem bioisostérica e de triagem virtual para identificar inibidores naturais da nsp3 do Alphavírus chikungunya
    (Universidade Federal de Alfenas, 2025-02-21) Lopes, Cássia Milene Ribeiro; Silveira, Nelson José Freitas Da; Santos, Breno Régis; Henrique, Tiago
    A febre Chikungunya, é caracterizada por quadro febril e dores articulares debilitantes que podem evoluir para a forma crônica. É uma doença ocasionada pelo vírus Chikungunya (CHIKV) transmitida aos humanos pela picada da fêmea do mosquito Aedes. Este vírus causa preocupação à saúde pública, visto que, parte da população mundial encontra-se em risco de infecção. Além de trazer efeitos negativos para a sociedade e perdas econômicas consideráveis, o quadro sintomatológico da CHIKV ainda não possui um fármaco específico para o tratamento. Dito isso, este trabalho tem como objetivo, realizar a predição (in silico) de compostos naturais que tenham atividade inibitória frente a uma proteína que atua na replicação viral do CHIKV. Utilizou-se a proteína não estrutural 3 do vírus como receptor, e 84.215 ligantes obtidos a partir do banco de dados ZINC20. O software Autodock Vina permitiu a realização da ancoragem molecular, pelos programas LigPlot+ e PyMol as interações e estruturas foram observadas; o servidor pkCSM, foi propício para as análises de características farmacocinéticas dos compostos, possibilitando a predição de fatores como absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade (ADME-Tox), por fim, o Bioisosterismo, foi executado através do servidor MolOpt, para melhorar a farmacocinética e desempenho dos compostos naturais identificados. Ao final das análises, foram obtidos três bioisósteros, Chikv_bio1, Chikv_bio2, Chikv_bio3 que contemplam boas energias de ligação, farmacocinética ideal, e realizam interações com o sítio ativo da proteína, sendo considerados potenciais compostos inibitórios da nsP3. Ademais, testes in vitro e in vivo, são necessários para confirmar os resultados preditivos aqui expostos, garantindo a continuidade na busca por um fármaco eficaz no tratamento da Chikungunya, doença que atinge parte da população e impacta diretamente na qualidade de vida dos pacientes.
  • Imagem de Miniatura
    ItemAcesso aberto (Open Access)
    Desenvolvimento de potenciais fármacos in silico para os principais carcinomas existentes no Brasil
    (Universidade Federal de Alfenas, 2024-08-01) Santos, Yana Cristina Albanez; Silveira, Nelson José Freitas Da; Azevedo Junior, Walter Filgueira De; Oliveira, Patrícia Rufino
    O câncer é uma das doenças que mais atinge a população mundial e com estimativas que o número de indivíduos com essa patologia cresça ≈ 50% em 2040 em relação a 2020. Portanto, o objetivo deste trabalho foi estabelecer e preparar bibliotecas de compostos sintéticos e naturais, a serem utilizados como potenciais fármacos, de forma in silico, através da afinidade dos compostos com a proteína alvo, farmacologia e farmacocinética. O método utilizou-se a molécula com o código PDB 7BIR, compostos naturais e sintéticos; realizou-se a ancoragem molecular, juntamente com o composto controle ancorado na molécula estabelecida; obteve-se informações 3D entre os compostos no sítio ativo da proteína, verificou-se as ligações químicas, estabeleceu-se a farmacocinética, farmacodinâmica e a regra de Lipinski. A partir das análises dos parâmetros e comparações com o composto controle, todos foram satisfatórios no bloqueio com da p53 e a MDM2, entretanto, os sintéticos sobressaíram na maioria das análises.
  • Imagem de Miniatura
    ItemAcesso aberto (Open Access)
    Prospecção in silico de novos ligantes contra o SARS-CoV-2
    (Universidade Federal de Alfenas, 2024-08-23) Santos, Débora Souza Dos; Silveira, Nelson José Freitas Da; Henrique, Tiago; Silva, José Maurício Schneedorf Ferreira Da
    O SARS-CoV-2, inicialmente circulando em ciclos enzoóticos, se disseminou para os humanos, desencadeando uma pandemia global declarada pela OMS em março de 2020. Apesar de apresentar um período de incubação prolongado e uma taxa evolutiva lenta, sua alta capacidade de infecção contribuiu para uma rápida disseminação. Variantes genômicas surgiram ao longo do tempo, exigindo análise contínua devido ao potencial impacto na transmissão e gravidade da doença, refletindo na ocorrência de algumas linhagens do vírus apresentarem certa resistência às vacinas, adicionando novos desafios ao controle da doença. Nesse contexto, ferramentas da bioinformática, como bioisosterismo, docking molecular e análises físico-químicas, farmacocinéticas (ADMET) e de drogabilidade têm se mostrado essenciais no desenvolvimento de fármacos, permitindo identificar e otimizar moléculas com potencial antiviral, além de estudo de interações entre complexos para identificação dos energeticamente estáveis. A presente pesquisa aplicou essas técnicas para definir uma molécula alvo e prospecção de ligantes com potencial farmacológico antiviral contra a COVID-19. Os resultados indicaram a NSP9 como receptor com alto nível conservativo e que, apesar de apresentar “limitações de drogabilidade", a interação receptor-ligante com o ácido micofenólico (MPA) apresentou interações energeticamente favoráveis, especialmente o complexo 1b. Além disso, por meio do bioisosterismo, foi gerado o isóster 1c, que demonstrou propriedades físico-químicas e farmacocinéticas superiores aos demais bioisósteros. No entanto, dentre todos, o MPA ainda se mostrou o ligante com maior potencial antiviral. Assim, a pesquisa sugere a continuidade dos estudos com os compostos MPA e 1c, além da exploração de outras técnicas de bioisosterismo, com o objetivo de obter melhores resultados e ampliar o potencial terapêutico contra a COVID-19.