Identificação in silico de potenciais inibidores da via wnt canônica em adenocarcinoma mamário humano

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Data

2018-07-25

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Universidade Federal de Alfenas

Resumo

O câncer de mama é a principal causa mundial de morte por câncer em mulheres, sendo o triplo-negativo o de pior prognóstico. A prospecção de novas substâncias com potencial antitumoral é importante para a contenção e tratamento da doença. O presente trabalho teve como objetivo a identificação e de um fármaco ou ligante comercial, a partir de análises de bioinformática, que potencialmente se ligue à proteína transmembrana FZD7 de forma a inativar a via de sinalização Wnt em células de adenocarcinoma mamário humano triplo-negativo (TMTN). Como objetivos específicos, pretendeu-se modelar computacionalmente as proteínas FZD7, Wnt3 e Wnt3a, disponibilizá-las em bancos de dados de modelos e realizar análises de docking para aferir a energia de ligação entre a FZD7 e os ligantes disponíveis comercialmente selecionados. Para a escolha das proteínas a serem estudadas foi feita uma pesquisa por proteínas superexpressas em TMTN no banco de dados GEO. As proteínas Wnt3 e Wnt3a foram modeladas por homologia, utilizando o software Modeller, e a FZD7 por homologia e por modelagem ab initio, com auxílio da ferramenta online I-TASSER. Foram gerados gráficos de Ramachandran e conduziu-se análises de RMSD para avaliar a qualidade estereoquímica dos modelos. Os ligantes foram selecionados com base em sua similaridade ao ácido palmitoleico, e foram tirados do banco de dados ZINC. Análises de docking com o software Autodock Vina foram conduzidas para aferir a energia de ligação entre o domínio rico em cisteína (CRD) da FZD7 e os ligantes encontrados. Os melhores modelos gerados para as proteínas Wnt3 e Wnt3a foram depositados no banco de dados público PMDB. Foram encontrados 30 ligantes disponíveis comercialmente em bancos de dados e foram realizadas análises de docking entre eles e o CRD da proteína FZD7. Os resultados apontam que os ligantes zinc08221009, zinc13546050, zinc05260769, zinc04529321 e zinc05972969 são candidatos promissores para o desenvolvimento de novos fármacos. A conhecimento dos autores, não há modelos de qualidade das proteínas Wnt3 e Wnt3a disponíveis atualmente em bancos de dados públicos. Os modelos gerados e análises conduzidas pelo presente trabalho serão disponibilizados publicamente e irão certamente beneficiar futuras pesquisas sobre a via de sinalização Wnt.



Palavras-chave

Biologia Computacional, Neoplasias da Mama, Via de Sinalização Wnt, Desenho de Drogas

Citação

PINTO, Icaro Alves. Identificação in silico de potenciais inibidores da via wnt canônica em adenocarcinoma mamário humano. 2018. 63 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Alfenas, Alfenas, MG, 2018.