Mestrado em Ciências Biológicas

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Navegando Mestrado em Ciências Biológicas por Orientador(a) "Paranaíba, Lívia Máris Ribeiro"

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    ItemAcesso aberto (Open Access)
    Própolis orgânica brasileira na prevenção e tratamento da mucosite oral: estudo in silico de biomoléculas desta própolis com alvos da mucosite oral.
    (Universidade Federal de Alfenas, 2021-07-29) Souza, Mikaela Lucinda De; Paranaíba, Lívia Máris Ribeiro; Cunha, Marcos Guilherme Da; Oliveira, Carine Ervolino De
    A mucosite oral (MO) é um processo inflamatório exacerbado da mucosa decorrente de terapia antineoplásica (e.g. radioterapia e/ou quimioterapia). A MO causa lesões ulcerativas, eritema e dor intensa, podendo afetar a fala, a alimentação, a eficácia e o tempo de tratamento, prolongar a hospitalização, diminuir a qualidade de vida e o aumento da mortalidade. Ainda não está claro o mecanismo pelo qual a MO se desenvolve, até o momento, acredita-se que haja ao menos 14 vias envolvidas na patogênese que se relaciona ao processo inflamatório, e com a liberação de espécies reativas de oxigênio (EROs). Essa falta de conhecimento, aliada a ausência de informações quanto às citocinas e quimiocinas específicas desse processo, dificulta o desenvolvimento de abordagens preventivas ou terapêuticas para a MO. Produtos naturais, como a própolis, têm sido investigados como possíveis fontes de biomoléculas para a atenuação da MO. A própolis é uma substância resinosa coletada de diversas plantas por abelhas que possui potencial antimicrobiano, anti-inflamatório, radioprotetor, anticancerígeno, antinociceptivo, entre outros. A própolis é capaz de modular a imunidade não específica, interferindo na produção de algumas citocinas pró- inflamatórias e neutralizar a produção de EROs. A própolis orgânica brasileira, especialmente do tipo 1 (PO1), possui uma alta atividade antioxidante e pode ser uma alternativa no tratamento da MO. Portanto, o objetivo do estudo é identificar os alvos moleculares relacionados à patogênese da MO, interagí-los com moléculas ativas identificadas e isoladas da PO1, por meio de estudo in silico de docking molecular e avaliar a biodisponibilidade das moléculas identificadas na PO1 pela ‘regra dos 5’ de Lipinski e absorção gastrointestinal, a partir do website SwissADME. Para o estudo de docking molecular, foram coletadas as informações químicas e estruturais dos alvos relacionados à patogênese da MO selecionados e das moléculas identificadas na PO1 (ligantes), que foram selecionadas na base Protein Data Bank (PDB) e PubChem, respectivamente. Neste estudo adotou-se duas estratégias metodológicas: I- Docking de 1 ligante e II- Docking de múltiplos ligantes. Utilizou-se como ferramentas os softwares AutoDock Vina ® e MGLTools ® , para a identificação e seleção dos sítios de ligação mais promissores; e o software Maestro  para a identificação dos sítios de ligação mais promissores e a identificação dos resíduos em que ocorreram as interações entre os alvos e os ligantes. Na estratégia I todos os sete ligantes identificados interagiram com todos os oito alvos, com a energia de ligação variando de -1,9 a -8,7 kcal.mol -1 . Na estratégia II observamos potencial atividade combinada de todos os 6 ligantes avaliados para com todos os 8 alvos, sendo que os ligantes demonstraram melhor atividade com a TNF-a. Também observamos que os resíduos dos alvos em que os ligantes interagiram são constituintes de enzimas proteases. Concluímos que todos os ligantes identificados na PO1, e analisados neste estudo, interagiram com todos os alvos de modo promissor, sugerindo uma possível atividade anti-inflamatória, multialvo e inibidora de proteases, sendo que estes ligantes são moléculas indicadas para estudos in vitro e in vivo.
    Oral mucositis (OM) is an exacerbated mucosal inflammatory process resulting from antineoplastic therapy (e.g. radiotherapy and/or chemotherapy). OM causes ulcerative lesions, erythema, and severe pain, which can affect speech, diet, efficacy, and duration of treatment, prolong hospitalization, decrease quality of life and increase mortality. The mechanism which OM develops is still unclear, so far, it is proposed that there are at least 14 pathways involved in the pathogenesis related to this condition, with the release of reactive oxygen species (ROS). This lack of knowledge and information regarding specific cytokines and chemokines related to this process makes it difficult to develop preventive or therapeutic approaches to OM. Natural products, such as propolis, have been investigated as possible sources of biomolecules for OM attenuation. Propolis is a resinous substance collected from several plants by bees that have antimicrobial, anti- inflammatory, radioprotective, anticancer, antinociceptive potential, among others. Propolis can modulate non-specific immunity, interfering with the production of some pro-inflammatory cytokines and neutralizing the production of ROS. Brazilian organic propolis, especially type 1 (PO1), has a high antioxidant activity and can be an alternative in the treatment of OM. Therefore, the study aims to identify the molecular targets involved in the pathogenesis of OM interacting them with active molecules identified and isolated from PO1, through an in silico study of molecular docking, and assess the bioavailability of the molecules identified in PO1 by Lipinski's 'rule of 5' and gastrointestinal absorption through the SwissADME website. For the study of molecular docking, chemical and structural information of selected OM pathogenesis related targets and molecules identified in PO1 (ligands) were collected, which were selected in the Protein Data Bank (PDB) and PubChem database, respectively. This study adopted two methodological strategies: I- 1-ligand docking and II- Multiple-ligand docking. The AutoDock Vina ® and MGLTools ® software were used to identify and select the most promising binding sites; and the Maestro  software for identifying the most promising binding sites and identifying the residues where interactions between targets and ligands occurred. In strategy I, all seven ligands interacted with all eight targets with binding energy ranging from -1.9 to -8.7 kcal.mol -1 . In strategy II, we observed potential combined activity of all 6 evaluated ligands for all 8 targets, the ligands showed better activity with TNF-a in general. We also observed that the residues from the targets where the ligands interacted were constituents of protease enzymes. We conclude that all ligands identified in PO1 and analyzed in this study promising interacted with all targets, suggesting a possible anti-inflammatory, multi-target, and protease inhibitory activity, and these ligands are suitable molecules for in vitro studies and in vivo.
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    ItemAcesso aberto (Open Access)
    Valor prognóstico da imunoexpressão de α-SMA em carcinoma espinocelular de língua e assoalho bucal
    (Universidade Federal de Alfenas, 2020-02-21) Castilho, Dayana Aparecida Queiroz; Paranaíba, Lívia Máris Ribeiro; Sobral, Lays Martin; Andrade, Ana Luiza Dias Leite De
    O carcinoma espinocelular (CEC) oral é um relevante problema de saúde pública, com taxa de sobrevida inferior a 50% em 5 anos, e não apresenta marcadores específicos capazes de predizer um prognóstico assertivo. No intuito de ampliar o conhecimento acerca dos eventos biológicos relacionados à carcinogênese oral, bem como validar o papel de marcadores que possam contribuir para o prognóstico de pacientes com esse tumor, este estudo objetivou avaliar o valor prognóstico da densidade de fibroblastos associados ao câncer (do inglês CAF - carcinoma-associated fibroblasts), por meio da imunomarcação da isoforma α da actina de musculatura lisa (α-SMA), tanto no fronte de invasão quanto no estroma tumoral, em 91 amostras (peças cirúrgicas) de CEC de língua e assoalho bucal diagnosticados e tratados no Hospital Bom Pastor, Varginha/MG, entre os anos de 1998 a 2012. Além disso, considerando que umas das principais alterações na 8ª edição da American Joint Committee on Cancer (AJCC) para estadiamento do câncer oral foi a inclusão da profundidade de invasão (depth of invasion - DOI) na categoria T, avaliamos a performance desta nova categoria na nossa amostra de CEC de língua e assoalho bucal relacionando com sobrevida e densidade de CAFs. Os resultados da análise clínico-epidemiológica revelaram um predomínio de pacientes do gênero masculino (74,7%), tabagistas (71,4%) e etilistas (52,7%). A maioria dos casos apresentou-se em estágio avançado III e IV (57,1%). Após 5 anos, análises de sobrevida evidenciaram que 65% dos pacientes estavam vivos e que 75% dos pacientes estavam livres de recorrência. Os resultados também revelaram que a abundante densidade de CAFs interferiu significativamente na sobrevida específica (risco de morte) de doença (p=0,005; OR: 3,94; IC 95%: 1,50-10,34) dos pacientes tanto no fronte de invasão quanto no estroma tumoral, resistindo (p=0,04) na análise multivariada de Cox após ajuste para outros fatores prognósticos. Ao analisar as diferentes classificações da AJCC (7ª e 8ª edição) quanto à categoria T, não se observou diferença significativa na análise de sobrevida e na abundância de densidade de CAFs (p=0,36 e p=0,40, respectivamente). Dessa maneira, os resultados deste estudo demonstraram que a densidade de CAFs pode ser uma ferramenta útil para determinar o prognóstico de CEC de língua e assoalho, tanto no fronte de invasão quanto no estroma tumoral. Além disso, mais estudos precisam ser encorajados para melhor avaliar a categoria T na 8ª classificação da AJCC considerando especialmente o adequado ponto de corte do estadio T e a melhor forma de mensuração do DOI.
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    ItemAcesso aberto (Open Access)
    Valor prognóstico de sistemas de gradação histopatológica e caracterização de marcadores em carcinoma espinocelular oral
    (Universidade Federal de Alfenas, 2018-07-26) Domingueti, Catherine Bueno; Paranaíba, Lívia Máris Ribeiro; Bufalino, Andreia; Oliveira, Carine Ervolino De
    O carcinoma espinocelular (CEC) oral é um relevante problema de saúde pública, com um prognóstico ainda sombrio (taxa de sobrevida reduzida inferior a 50% em 5 anos) e ainda não apresenta marcadores específicos capazes de predizer seu prognóstico. No intuito de um melhor compreender os fatores prognósticos relacionados à carcinogênese oral, este estudo objetivou avaliar o valor prognóstico de sistemas de gradação histopatológica, baseado no: modelo de brotamento e profundidade de invasão (modelo BD), modelo de risco histológico (modelo HR), modelo da Organização Mundial da Saúde (OMS), relação tumor-estroma (TSR) e TSR associado ao modelo BD (TSR e MBD). Adicionalmente avaliamos a imunoexpressão de proteínas relacionadas à tumorigênese oral como: stanniocalcina 2 (STC2), pró-peptídeo N-terminal do pró-colágeno tipo I (PINP), fator eucariótico de elongação delta 1 (EFF1D), Plectina e Fascina, em 124 amostras de CEC de língua e assoalho bucal oriundas do Brasil e Chile. Os resultados em análise univariada, revelaram que margens cirúrgicas comprometidas (p=0,05), mostrou significância para sobrevida específica de doença e resposta linfocitária tipo I e II (p=0,02) foi significante para sobrevida livre de doença. Em relação aos modelos observamos que escore alto dos modelos BD (p=0,05), da OMS (p=0,001) e HR (p=0,05) mostraram significância para sobrevida específica de doença. Mais de cinco brotamentos no fronte de invasão (p=0,03; p=0,01), e escore alto da associação de TRS e MBD (p=0,05; p=0,01), mostraram significância para sobrevida específica e livre de doença. Associação de TSR e MBD resistiu à análise multivariada de Cox para os sistemas de gradações histopatológicas, após ajuste para outros fatores prognósticos, considerando tanto sobrevida específica (p=0,03) quanto a livre de doença (p=0,03). Em relação aos marcadores a alta imunoexpressão de STC2 (p=0,05; p=0,02) revelaram significância para sobrevida específica e resistiram para sobrevida livre de doença e mais de 50% de células marcadas no estroma com PINP (p=0,04) mostraram significância para sobrevida livre de doença. Marcadores imuno-histoquímicos com TSR e MBD, em análise multivariada de Cox, os parâmetros resistentes foram margens cirúrgicas comprometidas (p=0,03) para sobrevida específica de doença e sequência de tratamento multimodalidade (p=0,02) e alta imunoexpressão de STC2 (p=0,04) para sobrevida livre de doença. A associação de TSR e MBD revelou um importante sistema de gradação histológica e tal modelo pode ser útil como auxiliar para estabelecer o prognóstico para CEC de língua e assoalho bucal. Além disso, constatou-se que STC2 e PINP a utilidade de um possível fator prognóstico para o CEC língua e assoalho bucal.